Intégré dans la filière de neuroréhabilitation vaudoise, l'hôpital de l'Institution de Lavigny est aujourd'hui l'un des centres romands de référence pour les patients avec des lésions cérébrales nécessitant une réhabilitation neurologique ou pour ceux souffrant d'épilepsie difficile à traiter. L'organisation de la prise en charge veille à ce que chaque patient soit au bon endroit au bon moment, disposant de tous les moyens adaptés à ses besoins et aux objectifs thérapeutiques. En plus de son service d'hospitalisation, l'établissement propose des prestations ambulatoires dans toutes ses activités médicales.